Импорт массива из Matlab в R

Question

Я уверен, что это простая проблема, но я не смог найти очевидного решения. У меня есть ряд файлов выходных массивов моделей (dim 180, 360, 12), сгенерированных в Matlab, которые мне нужно открыть в R.

Я попытался использовать пакет R.matlab, просто используя команду readMat, и в результате появился объект списка. Попытка записать этот список в матрицу приводит к ошибке выделения памяти.

Я пробовал распечатывать, но это тоже не помогло.

Как я могу открыть эти файлы матрицы Matlab и записать в виде матрицы в R? Какие-нибудь мысли?

---

код для чтения Matlab до сих пор просто:

> data<-readMat("filename")
> typeof(data)
[1] "list"
> str(data)
List of 1
 $ pco2: num [1:180, 1:360, 1:12] NaN NaN NaN NaN NaN ...
 - attr(*, "header")=List of 3
 ..$ description: chr "MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: GLNXA64, Created on: Thu Jul 26 10:36:42 2012 "
 ..$ version : chr "5"
 ..$ endian : chr "little

Answer 1

Пожалуйста, проверьте ваш файл внутри MATLAB и убедитесь, что не все значения являются NaN. Просто загрузите файл в MATLAB и проверьте его содержимое:

load file.mat

Вот простой тест, который я только что сделал:

MATLAB

>> x = rand(3,4,2)

x(:,:,1) =
      0.75127      0.69908      0.54722      0.25751
       0.2551       0.8909      0.13862      0.84072
      0.50596      0.95929      0.14929      0.25428
x(:,:,2) =
      0.81428      0.34998      0.61604      0.83083
      0.24352       0.1966      0.47329      0.58526
      0.92926      0.25108      0.35166      0.54972

>> save file.mat x

р

R> library(R.matlab)
R> data <- readMat('file.mat')
R> str(data)
List of 1
 $ x: num [1:3, 1:4, 1:2] 0.751 0.255 0.506 0.699 0.891 ...
 - attr(*, "header")=List of 3
  ..$ description: chr "MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN, Created on: ..."
  ..$ version    : chr "5"
  ..$ endian     : chr "little"
R> data$x
, , 1

       [,1]   [,2]   [,3]   [,4]
[1,] 0.7513 0.6991 0.5472 0.2575
[2,] 0.2551 0.8909 0.1386 0.8407
[3,] 0.5060 0.9593 0.1493 0.2543

, , 2

       [,1]   [,2]   [,3]   [,4]
[1,] 0.8143 0.3500 0.6160 0.8308
[2,] 0.2435 0.1966 0.4733 0.5853
[3,] 0.9293 0.2511 0.3517 0.5497