Интерполяция сгруппированных данных с использованием data.table
Это продолжение вопроса, который я первоначально разместил по адресу http://r.789695.n4.nabble.com/subset-between-data-table-list-and-single-data-table-object-tp4673202.html, Мэтью предложил мне опубликовать свой вопрос здесь, поэтому я делаю это сейчас.
Это мой вклад ниже:
library(data.table)
library(pracma) # for the interp1 function
tempbigdata1 <- data.table(c(14.80, 14.81, 14.82), c(7900, 7920, 7930), c("02437100", "02437100", "02437100"))
tempbigdata2 <- data.table(c(9.98, 9.99, 10.00), c(816, 819, 821), c("02446500", "02446500", "02446500"))
tempbigdata3 <- data.table(c(75.65, 75.66, 75.67), c(23600, 23700, 23800), c("02467000", "02467000", "02467000"))
tempsbigdata <- rbind(tempbigdata1, tempbigdata2, tempbigdata3)
setnames(tempsbigdata,c("y", "x", "site_no"))
setkey(tempsbigdata, site_no)
tempsbigdata
y x site_no
1: 14.80 7900 02437100
2: 14.81 7920 02437100
3: 14.82 7930 02437100
4: 9.98 816 02446500
5: 9.99 819 02446500
6: 10.00 821 02446500
7: 75.65 23600 02467000
8: 75.66 23700 02467000
9: 75.67 23800 02467000
aimsmall <- data.table(c("02437100", "02446500", "02467000"), c(3882.65, 819.82, 23742.37), c(1830.0, 382.0, 10400.0))
setnames(aimsmall,c("site_no", "mean", "p50"))
setkey(aimsmall, site_no)
aimsmall
site_no mean p50
1: 02437100 3882.65 1830
2: 02446500 819.82 382
3: 02467000 23742.37 10400
Я использую этот код для генерации интерполированного tempsbigdata$y
с использованием aimsmall$mean
значения по site_no
:
meanpre <- tempsbigdata[,if(aimsmall$mean > min(tempsbigdata$x){
interp1(tempsbigdata$x, tempsbigdata$y,
xi = aimsmall$mean, method ="linear")},by=site_no]
Это вывод из функции meanpre
, но это не правильно.
meanpre
site_no V1
1: 02437100 12.07599
2: 02437100 9.99410
3: 02437100 19.56813
4: 02446500 12.07599
5: 02446500 9.99410
6: 02446500 19.56813
7: 02467000 12.07599
8: 02467000 9.99410
9: 02467000 19.56813
Вот что я хотел бы получить:
meanpre
site_no V1
1: 02446500 9.99
2: 02467000 75.66
Какие-либо предложения? Спасибо.
ОБНОВЛЕНИЕ 1:
Хью, я использовал функцию приближения в прошлом, и она не точна для моих данных; Тем не менее interp1
функция в pracma
это точно. mean
а также p50
столбцы в aimsmall
& x
значения в tempsbigdata
значения разряда. y
в tempsbigdata
представляют высоты датчика. Я использую interp1
функция для определения соответствующей высоты датчика или y
значение для значений разряда или mean
(а также p50
).
Фрэнк, спасибо за твой совет и предложенный код. Это вывод для вашего предложенного кода:
tempsbigdata[aimsmall][,if(mean[1] > min(x)){interp1(tempsbigdata$x,tempsbigdata$y, xi = aimsmall$mean, method ="linear")},by=site_no]
site_no V1
1: 02446500 12.07599
2: 02446500 9.99410
3: 02446500 75.66424
4: 02467000 12.07599
5: 02467000 9.99410
6: 02467000 75.66424
Когда я запускаю следующий код, я получаю результат ниже:
interp1(tempsbigdata$x, tempsbigdata$y, xi = aimsmall$mean, method ="linear")
[1] 12.07599 9.99410 75.66424
Есть ли способ получить это взамен? Спасибо.
site_no V1
1: 02446500 9.99
2: 02467000 75.66
ОБНОВЛЕНИЕ 2
Фрэнк, спасибо, и я добавил код, чтобы упростить получение данных в R. Pracma - это пакет процедур числового метода R, которые были перенесены из GNU Octave [аналогично MATLAB(R)] в R. interp1
функция является одномерной интерполяционной функцией.
Фрэнк, это было прекрасно (твой последний комментарий о коде R для "do stuff"):
tempsbigdata[aimsmall][,if(mean[1] > min(x)){interp1(x, y, xi = mean[1], method ="linear")},by=site_no]
site_no V1
1: 02446500 9.99410
2: 02467000 75.66424