Как установить определенный уровень контрастности с помощью lmer в lme4

У меня есть смешанная модель, содержащая переменную отклика (соответственно), два фиксированных эффекта (fix1 и fix2) и случайный фактор (ran1). Особенно:

  1. fix1 имеет 2 уровня (контроль и лечение);
  2. fix2 имеет 7 уровней (от 1 до 7, указывающих время в категориальном смысле);
  3. Ран1 имеет 6 уровней (графики были спарены, а пара используется в качестве случайной величины).

Примером типа данных, которые я использую, является

library("tidyr")
library("dplyr")
set.seed(123)
DF <- data.frame(resp = rnorm(84, -2, 1),
             fix1 = c(rep("C",42),rep("Trt",42)), 
             fix2 = c(rep("1",6),rep("2",6),rep("3",6),rep("4",6),rep("5",6),rep("6",6),rep("7",6),
                      rep("1",6),rep("2",6),rep("3",6),rep("4",6),rep("5",6),rep("6",6),rep("7",6)),
             ran1 = c(rep(1:6,14)))
DF

Из приведенного выше примера видно, что:

  1. экспериментальный дизайн полностью факториален (fix1 * fix2);
  2. Все участки были отобраны в каждом случае (7 уровней Fix2).

В смешанной модели, содержащей взаимодействие между fix1 и fix2,

LME <- lmer(resp ~ fix1 * fix2 + (1 | ran1), DF)

Я хотел бы сравнить (для fix2):

  1. среднее из уровней 1 и 2 против среднего из уровней 3, 4 и 5;
  2. среднее по уровням 3, 4 и 5 против среднего по уровням 6 и 7;
  3. среднее по уровням 1 и 2 против среднего по уровням 6 и 7.

Мои вопросы:

  • Как мне установить контрасты (в lmer) таким образом, чтобы я мог сравнить три "новых" уровня, составленных из средних значений, указанных выше?
  • как интерпретировать взаимодействие между fix1 и новыми указанными уровнями?

0 ответов

Другие вопросы по тегам