Переменная длина отметок оси в редакторе ggplot: основные и второстепенные отметки

Я создаю график, показывающий доступные данные для экспериментальных установок с использованием ggplot. Моя проблема в том, что ось Y становится слишком тесной, поэтому я бы хотел, чтобы все остальные метки были длиннее, что позволило бы использовать больший шрифт для меток оси.

Моя цель состоит в том, чтобы построить график числа полевых установок в зависимости от возраста при измерении, показать все доступные данные и отсортировать их по возрасту при первом измерении. Вот пример использования псевдоданных. Обратите внимание, что порядок построения установок на оси Y зависит от возраста при первом измерении.

# create data frame of fake values
set.seed(1)
plots <- data.frame(installation=rep(sample(seq(1,100,1), 10), each=10),
                    age=as.vector(replicate(10, sample(seq(1,50,1), 10))))

# set up installations as factor, sorted by age at first measurement
odr <- ddply(plots, .(installation), summarize, youngest = min(age))
odr <- odr[order(odr$youngest),]
plots$installation <- factor(plots$installation, levels=rev(as.numeric(as.character(odr$installation))))
rm(odr)

# plot the available data
ggplot(plots, aes(installation, age)) + 
  geom_point() +
  coord_flip() 

На самом деле у меня есть около 60 инсталляций и лейбл для каждой, так что становится тесно. Смещая все остальные отметки оси Y немного дольше, я могу использовать больший шрифт для надписей. Это вопрос, на который я надеюсь получить ответ.

Я попытался построить четные и нечетные факторы по отдельности, что позволило бы мне поиграть с метками осей для каждого, но порядок упал, и я не уверен, почему. Если есть способ получить эффект тика оси, я по другому, я не женат на этом подходе.

# break up the data frame into odd and even factors
odds <- plots[as.numeric(plots$installation) %% 2 != 0,]
evens <- plots[as.numeric(plots$installation) %% 2 == 0,]

# try and plot odds and evens seperately
ggplot(odds, aes(installation, age)) + 
  geom_point() +
  coord_flip() +
  geom_point(data = evens, aes(installation, age))

Спасибо!

2 ответа

Решение

Хорошо, понял это с помощью jhoward выше и с этим вопросом.

Хитрость заключается в том, чтобы наметить второстепенные отметки на исходном графике, а затем добавить основные отметки, используя annotation_custom.

Используя набор данных сверху:

# base plot
base <- ggplot(plots, aes(age,installation)) +
  geom_point() +
  scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[c(2,4,6,8,10)]) +
  scale_x_continuous(expand=c(0,1)) +
  theme(axis.text=element_text(size=10),
        axis.title.y=element_text(vjust=0.1))

# add the tick marks at every other facet level
for (i in 1:length(plots$installation)) {
  if(as.numeric(plots$installation[i]) %% 2 != 0) {
    base = base + annotation_custom(grob = linesGrob(gp=gpar(col= "dark grey")),  
                              ymin = as.numeric(plots$installation[i]), 
                              ymax = as.numeric(plots$installation[i]), 
                              xmin = -1.5, 
                              xmax = 0)
  }
}

# add the labels at every other facet level
for (i in 1:length(plots$installation)) {
  if(as.numeric(plots$installation[i]) %% 2 != 0) {
    base = base + annotation_custom(grob = textGrob(label = plots$installation[i], 
                                                    gp=gpar(col= "dark grey", fontsize=10)),  
                                    ymin = as.numeric(plots$installation[i]), 
                                    ymax = as.numeric(plots$installation[i]), 
                                    xmin = -2.5, 
                                    xmax = -2.5)
  }
}

# create the plot
gt <- ggplot_gtable(ggplot_build(base))
gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
grid.draw(gt)

Нечто подобное помечало бы каждую другую галочку:

 ggplot(plots, aes(age,installation))+
   geom_point()+
   scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[c(2,4,6,8,10)])

Это работает в общем случае:

lvls <- levels(plots$installation)
brks <- 2*(1:(length(lvls)/2)) 
ggplot(plots, aes(age,installation))+
  geom_point()+
  scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[brks])
Другие вопросы по тегам