Q: Не удается установить алгоритм DTW в ноутбуке DSX R

Question

Я пытаюсь установить DTW пакет R в ноутбуке DSX R. при запуске команды install: install.packages("dtw") выдает следующую ошибку: предупреждение "установка пакета 'dtw' имела ненулевой статус выхода".

Answer 1

Дополнительный вывод от попытки установки может быть найден в файле журнала для вашего ядра R. В записной книжке R выполните

Sys.getenv("LOG_FILE")

чтобы получить имя файла журнала. Затем откройте записную книжку Python и выполните

!cat <name-of-the-log-file>

чтобы увидеть содержимое файла журнала.

После попытки установить dtw мой файл журнала показал:

gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib64 -o dtw.so computeCM.o Launching java with spark-submit command /usr/local/src/spark20master/spark/bin/spark-submit sparkr-shell /gpfs/fs01/user/s10d-7f8820dde34dec-4cf890276e2b/notebook/tmp/RtmpofrZnw/backend_portd1c4793df5e

который выглядит как искаженный вывод журнала двумя процессами, записывающими в один и тот же файл журнала. Но чуть ниже я нахожу:

gcc: error: Launching: No such file or directory
gcc: error: java: No such file or directory
gcc: error: with: No such file or directory
gcc: error: spark-submit: No such file or directory
gcc: error: command: No such file or directory
gcc: error: sparkr-shell: No such file or directory
gcc: error: /gpfs/fs01/user/s10d-7f8820dde34dec-4cf890276e2b/notebook/tmp/Rtmpkh93V2/backend_porte8853270b27: No such file or directory
make: *** [dtw.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘dtw’

Таким образом, искаженная линия была фактически выполнена. Я бы сказал, что логика установки для пакета dtw делает некоторые предположения о среде, которые не устраивают в DSX.

Чтобы углубиться в проблему, вам нужно будет отладить установщик dtw или найти кого-то, кто может сделать это за вас.