MySQLdb: ошибка базы данных Pandas в базу данных SQL: не все аргументы преобразованы во время форматирования строки

Question

Итак, я хотел переместить фрейм данных в базу данных в таблицу, но у меня возникло несколько проблем. Я сделал фрейм данных, используя библиотеку pandas, и хотел загрузить данные в таблицу в моей базе данных.

Соответствующие фрагменты моего кода и подробности ошибки приведены ниже:

#CONNECTION TO SQL DATABASE
db=sql.connect(host="localhost",user="root",passwd="password",db="database_name")
cur=db.cursor()
#CONVERTING DATAFRAME(df_final) INTO TABLE
df_final.to_sql(con=db, name='finaltable', if_exists='replace', chunksize=5000)

Детали ошибки:

Traceback (most recent call last):
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\M
ySQLdb\cursors.py", line 238, in execute
query = query % args
TypeError: not all arguments converted during string formatting

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 1400, in execute
cur.execute(*args)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\M
ySQLdb\cursors.py", line 240, in execute
self.errorhandler(self, ProgrammingError, str(m))
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\M
ySQLdb\connections.py", line 52, in defaulterrorhandler
raise errorclass(errorvalue)
_mysql_exceptions.ProgrammingError: not all arguments converted during string fo
rmatting

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
File "pt.py", line 77, in <module>
df_final.to_sql(con=db, name='finaltable', if_exists='replace', chunksize=50
00)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\core\generic.py", line 2127, in to_sql
dtype=dtype)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 450, in to_sql
chunksize=chunksize, dtype=dtype)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 1502, in to_sql
table.create()
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 561, in create
if self.exists():
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 549, in exists
return self.pd_sql.has_table(self.name, self.schema)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 1514, in has_table
return len(self.execute(query, [name, ]).fetchall()) > 0
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 1412, in execute
raise_with_traceback(ex)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\compat\__init__.py", line 403, in raise_with_traceback
raise exc.with_traceback(traceback)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\p
andas\io\sql.py", line 1400, in execute
cur.execute(*args)
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\M
ySQLdb\cursors.py", line 240, in execute
self.errorhandler(self, ProgrammingError, str(m))
File "C:\Users\DELL\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\M
ySQLdb\connections.py", line 52, in defaulterrorhandler
raise errorclass(errorvalue)
pandas.io.sql.DatabaseError: Execution failed on sql 'SELECT name FROM 
sqlite_ma
ster WHERE type='table' AND name=?;': not all arguments converted during string
formatting

Answer 1

Таким образом, очевидно, что мой подход устарел из-за обновлений, и поэтому для бита подключения я использовал "create_engine" из библиотеки "sqlalchemy" вместо "mysqldb.connect()" для доступа к базе данных:

#relevant import:
from sqlalchemy import create_engine

#accessing database:
engine = create_engine("mysql://root:PASSWORD@host/database_name")
con = engine.connect()

#uploading dataframe to database:
df.to_sql(con=con, name='final_table', if_exists='replace', chunksize=10000)

Answer 2

Мне кажется, что в данных есть нули. Попробуйте заполнить нулями в кадре данных перед вызовом.to_sql()

df_final.fillna('default string')

Или удалить нулевые строки

df_final.dropna(inplace=True)