Как заштриховать область под гистограммой ggridges (stat = binline)?

Question

Использование предложения доктора Эверса для затенения областей под кривой плотности с помощью ggridges работает хорошо. Тем не менее, я считаю, что кривые плотности могут быть обманчивы в том смысле, что они подразумевают наличие данных, когда их нет. Таким образом, я думал, что попробую эту технику затенения с обычной гистограммой.

Однако, когда я пытаюсь использовать это с гистограммой, затенение немного отклоняется. Почему это?

library(tidyverse)
install.packages("ggridges", dependencies=TRUE)  # there are many
library(ggridges)
 t2 <-   structure(list(Date = c("1853-01", "1853-02", "1853-03", "1853-04", 
"1853-05", "1853-06", "1853-07", "1853-08", "1853-09", "1853-10", 
"1853-11", "1853-12", "1854-01", "1854-02", "1854-03", "1854-04", 
"1854-05", "1854-06", "1854-07", "1854-08", "1854-09", "1854-10", 
"1854-11", "1854-12"), t = c(-5.6, -5.3, -1.5, 4.9, 9.8, 17.9, 
18.5, 19.9, 14.8, 6.2, 3.1, -4.3, -5.9, -7, -1.3, 4.1, 10, 16.8, 
22, 20, 16.1, 10.1, 1.8, -5.6), year = c("1853", "1853", "1853", 
"1853", "1853", "1853", "1853", "1853", "1853", "1853", "1853", 
"1853", "1854", "1854", "1854", "1854", "1854", "1854", "1854", 
"1854", "1854", "1854", "1854", "1854")), row.names = c(NA, -24L
), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"), .Names = c("Date", 
"t", "year"))


gg <- ggplot(t2, aes(x = t, y = year)) +
      geom_density_ridges(stat = "binline", bins = 10, scale = 0.8, 
                      draw_baseline = TRUE) +
      theme_ridges()

# Build ggplot and extract data
d <- ggplot_build(gg)$data[[1]]

# Add geom_ribbon for shaded area
gg +
  geom_ribbon(
    data = transform(subset(d, x >= 10), year = group),
    aes(x, ymin = ymin, ymax = ymax, group = group),
    fill = "red",
    alpha = 1.0) 

Answer 1

Следующее работает, если вы хотите изменить размеры и переместить ячейки так, чтобы граница ячейки находилась точно на вашей демаркационной линии (здесь 10).

ggplot(t2, aes(x = t, y = year, fill = ifelse(..x..>=10, ">= 10", "< 10"))) +
  geom_density_ridges_gradient(stat = "binline", binwidth = 3,
                               center = 8.5, scale = 0.8, 
                               draw_baseline = TRUE) +
  theme_ridges() +
  scale_fill_manual(values = c("gray70", "red"), name = NULL)

Причина, по которой вы наблюдаете эффект, который вы делаете, заключается в том, что ось x изменяется между первым и вторым графиком, а диапазон оси x влияет на то, как отображаются элементы. Существует два решения: вы можете либо зафиксировать диапазон оси x, либо определить ячейки с помощью center а также binwidth скорее, чем bins, (Второй вариант предпочтителен всегда, на мой взгляд, независимо от того, как вы относитесь к оси х.)

Сначала исправьте диапазон оси x:

gg <- ggplot(t2, aes(x = t, y = year)) +
  geom_density_ridges(stat = "binline", bins = 10, scale = 0.8, 
                      draw_baseline = TRUE) +
  theme_ridges() +
  scale_x_continuous(limits = c(-12, 28)) # this is where the change is

# Build ggplot and extract data
d <- ggplot_build(gg)$data[[1]]

# Add geom_ribbon for shaded area
gg +
  geom_ribbon(
    data = transform(subset(d, x >= 10), year = group),
    aes(x, ymin = ymin, ymax = ymax, group = group),
    fill = "red",
    alpha = 1.0) 

Во-вторых, определение альтернативного бина:

gg <- ggplot(t2, aes(x = t, y = year)) +
  geom_density_ridges(stat = "binline",
                      binwidth = 3, center = 8.5, # this is where the change is
                      scale = 0.8, draw_baseline = TRUE) +
  theme_ridges()

# Build ggplot and extract data
d <- ggplot_build(gg)$data[[1]]

# Add geom_ribbon for shaded area
gg +
  geom_ribbon(
    data = transform(subset(d, x >= 10), year = group),
    aes(x, ymin = ymin, ymax = ymax, group = group),
    fill = "red",
    alpha = 1.0) 

Answer 2

Там действительно что-то странное происходит. Пожалуйста, смотрите ниже "заключение".

1. Если мы заговор gg только:

    gg;
   

   

2. Если мы заговор gg плюс ступенька, которая должна соответствовать следу gg:

     gg +
         geom_step(
             data = d, 
             aes(xmax, ymax, group = group), 
             direction = "vh", col = "red",  size = 2);
   

Итак, добавление geom_step как-то меняется gg , Я не понимаю, как это могло быть. Ты это видишь geom_step (красная кривая) на самом деле соответствует трассе гистограммы при построении gg сам по себе (см. первый сюжет).