Как избежать ":" в библиографической ссылке с pandoc?

Question

В основном, у меня есть файл bibtex, который автоматически генерируется Zotero 4.0.17, и я использую его для создания библиографии в файле уценки. Используемые инструменты: pandoc-1.12.1 и pandoc-citeproc-0.2 .

Это файл уценки с именем notes.md

# State of the art

 - Wikipathways [@pico_wikipathways\:_2008]

# Bibliography

<!-- TODO is this usefull?
bibliography::research.bib -->
<!-- \bibliography{research} So that RefTeX knows about the bibliography -->

Это файл bibtex с именем research.bib

@ARTICLE{pico_wikipathways:_2008,
 author = {Pico, Alexander R and Kelder, Thomas and van Iersel, Martijn P and Hanspers, Kristina and Conklin, Bruce R and Evelo, Chris},
 title = {{WikiPathways:} Pathway Editing for the People},
 journal = {{PLoS} Biol},
 year = {2008},
 volume = {6},
 pages = {e184},
 number = {7},
 month = jul,
 abstract = {{WikiPathways} provides a collaborative platform for creating, updating, and sharing pathway diagrams and serves as an example of content  curation by the biology community.},
 doi = {10.1371/journal.pbio.0060184},
 keywords = {\_tablet},
 shorttitle = {{WikiPathways}},
 url = {http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.0060184},
 urldate = {2013-11-20}
}

И это команда, которую я запускаю

pandoc --bibliography=research.bib notes.md -o notes.md.pdf

Я ожидал, что все будет хорошо, но присутствие : символ делает генерацию PDF успешным со следующей ошибкой

pandoc-citeproc: reference pico_wikipathways not found

PDF будет содержать неправильную библиографию.

Любая идея, как избежать : в notes.md чтобы библиографическая ссылка была распознана?

Answer 1

Вам придется изменить свой ключ. В настоящее время синтаксический анализатор ключа цитирования Pandoc не допускает использование более одного не буквенно-цифрового символа в строке, поэтому ключ с :_ выходит из строя. Кроме того, не используйте обратную косую черту до : в ключе цитирования.

Answer 2

Похоже, эта проблема была исправлена ​​в версии 1.12.3. Удалите текущую версию, используя

sudo rm -f /usr/local/bin/pandoc /usr/local/doc/pandoc-1.9.4.2 /usr/local/share/man/man1/pandoc.1.gz /usr/local/share/man/man5/pandoc_markdown.5.gz /usr/local/share/pandoc-1.9.4.2

затем переустановите pandoc, и все будет хорошо.