Добавить общую легенду для комбинированных ggplots
У меня есть два ggplots, которые я выравниваю по горизонтали grid.arrange, Я просмотрел много постов на форуме, но все, что я пытаюсь сделать, похоже, это команды, которые теперь обновлены и названы как-то иначе.
Мои данные выглядят так:
# Data plot 1
axis1 axis2
group1 -0.212201 0.358867
group2 -0.279756 -0.126194
group3 0.186860 -0.203273
group4 0.417117 -0.002592
group1 -0.212201 0.358867
group2 -0.279756 -0.126194
group3 0.186860 -0.203273
group4 0.186860 -0.203273
# Data plot 2
axis1 axis2
group1 0.211826 -0.306214
group2 -0.072626 0.104988
group3 -0.072626 0.104988
group4 -0.072626 0.104988
group1 0.211826 -0.306214
group2 -0.072626 0.104988
group3 -0.072626 0.104988
group4 -0.072626 0.104988
#And I run this:
library(ggplot2)
library(gridExtra)
groups=c('group1','group2','group3','group4','group1','group2','group3','group4')
x1=data1[,1]
y1=data1[,2]
x2=data2[,1]
y2=data2[,2]
p1=ggplot(data1, aes(x=x1, y=y1,colour=groups)) + geom_point(position=position_jitter(w=0.04,h=0.02),size=1.8)
p2=ggplot(data2, aes(x=x2, y=y2,colour=groups)) + geom_point(position=position_jitter(w=0.04,h=0.02),size=1.8)
#Combine plots
p3=grid.arrange(
p1 + theme(legend.position="none"), p2+ theme(legend.position="none"), nrow=1, widths = unit(c(10.,10), "cm"), heights = unit(rep(8, 1), "cm")))
Как мне извлечь легенду из любого из этих графиков и добавить ее в конец / центр комбинированного графика?
7 ответов
Обновление 2015-февраль
Смотрите ответ Стивена ниже
df1 <- read.table(text="group x y
group1 -0.212201 0.358867
group2 -0.279756 -0.126194
group3 0.186860 -0.203273
group4 0.417117 -0.002592
group1 -0.212201 0.358867
group2 -0.279756 -0.126194
group3 0.186860 -0.203273
group4 0.186860 -0.203273",header=TRUE)
df2 <- read.table(text="group x y
group1 0.211826 -0.306214
group2 -0.072626 0.104988
group3 -0.072626 0.104988
group4 -0.072626 0.104988
group1 0.211826 -0.306214
group2 -0.072626 0.104988
group3 -0.072626 0.104988
group4 -0.072626 0.104988",header=TRUE)
library(ggplot2)
library(gridExtra)
p1 <- ggplot(df1, aes(x=x, y=y,colour=group)) + geom_point(position=position_jitter(w=0.04,h=0.02),size=1.8) + theme(legend.position="bottom")
p2 <- ggplot(df2, aes(x=x, y=y,colour=group)) + geom_point(position=position_jitter(w=0.04,h=0.02),size=1.8)
#extract legend
#https://github.com/hadley/ggplot2/wiki/Share-a-legend-between-two-ggplot2-graphs
g_legend<-function(a.gplot){
tmp <- ggplot_gtable(ggplot_build(a.gplot))
leg <- which(sapply(tmp$grobs, function(x) x$name) == "guide-box")
legend <- tmp$grobs[[leg]]
return(legend)}
mylegend<-g_legend(p1)
p3 <- grid.arrange(arrangeGrob(p1 + theme(legend.position="none"),
p2 + theme(legend.position="none"),
nrow=1),
mylegend, nrow=2,heights=c(10, 1))
Вот результирующий сюжет:
Вы также можете использовать ggarrange из пакета ggpubr и установить "common.legend = TRUE":
library(ggpubr)
dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
p1 <- qplot(carat, price, data = dsamp, colour = clarity)
p2 <- qplot(cut, price, data = dsamp, colour = clarity)
p3 <- qplot(color, price, data = dsamp, colour = clarity)
p4 <- qplot(depth, price, data = dsamp, colour = clarity)
ggarrange(p1, p2, p3, p4, ncol=2, nrow=2, common.legend = TRUE, legend="bottom")
Новое привлекательное решение - использовать patchwork. Синтаксис очень прост:
library(ggplot2)
library(patchwork)
p1 <- ggplot(df1, aes(x = x, y = y, colour = group)) +
geom_point(position = position_jitter(w = 0.04, h = 0.02), size = 1.8)
p2 <- ggplot(df2, aes(x = x, y = y, colour = group)) +
geom_point(position = position_jitter(w = 0.04, h = 0.02), size = 1.8)
combined <- p1 + p2 & theme(legend.position = "bottom")
combined + plot_layout(guides = "collect")
Создано 13.12.2019 пакетом REPEX (v0.2.1)
Ответ Роланда нуждается в обновлении. Смотрите: https://github.com/hadley/ggplot2/wiki/Share-a-legend-between-two-ggplot2-graphs
Этот метод был обновлен для ggplot2 v1.0.0.
library(ggplot2)
library(gridExtra)
library(grid)
grid_arrange_shared_legend <- function(...) {
plots <- list(...)
g <- ggplotGrob(plots[[1]] + theme(legend.position="bottom"))$grobs
legend <- g[[which(sapply(g, function(x) x$name) == "guide-box")]]
lheight <- sum(legend$height)
grid.arrange(
do.call(arrangeGrob, lapply(plots, function(x)
x + theme(legend.position="none"))),
legend,
ncol = 1,
heights = unit.c(unit(1, "npc") - lheight, lheight))
}
dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
p1 <- qplot(carat, price, data=dsamp, colour=clarity)
p2 <- qplot(cut, price, data=dsamp, colour=clarity)
p3 <- qplot(color, price, data=dsamp, colour=clarity)
p4 <- qplot(depth, price, data=dsamp, colour=clarity)
grid_arrange_shared_legend(p1, p2, p3, p4)
Обратите внимание на отсутствие ggplot_gtable а также ggplot_build, ggplotGrob используется вместо Этот пример немного более запутанный, чем приведенное выше решение, но он все же решил его для меня.
Я предлагаю использовать cowplot. Из их виньетки R:
# load cowplot
library(cowplot)
# down-sampled diamonds data set
dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
# Make three plots.
# We set left and right margins to 0 to remove unnecessary spacing in the
# final plot arrangement.
p1 <- qplot(carat, price, data=dsamp, colour=clarity) +
theme(plot.margin = unit(c(6,0,6,0), "pt"))
p2 <- qplot(depth, price, data=dsamp, colour=clarity) +
theme(plot.margin = unit(c(6,0,6,0), "pt")) + ylab("")
p3 <- qplot(color, price, data=dsamp, colour=clarity) +
theme(plot.margin = unit(c(6,0,6,0), "pt")) + ylab("")
# arrange the three plots in a single row
prow <- plot_grid( p1 + theme(legend.position="none"),
p2 + theme(legend.position="none"),
p3 + theme(legend.position="none"),
align = 'vh',
labels = c("A", "B", "C"),
hjust = -1,
nrow = 1
)
# extract the legend from one of the plots
# (clearly the whole thing only makes sense if all plots
# have the same legend, so we can arbitrarily pick one.)
legend_b <- get_legend(p1 + theme(legend.position="bottom"))
# add the legend underneath the row we made earlier. Give it 10% of the height
# of one plot (via rel_heights).
p <- plot_grid( prow, legend_b, ncol = 1, rel_heights = c(1, .2))
p
@Giuseppe, вы можете рассмотреть это для гибкой спецификации расположения графиков (изменено здесь):
library(ggplot2)
library(gridExtra)
library(grid)
grid_arrange_shared_legend <- function(..., nrow = 1, ncol = length(list(...)), position = c("bottom", "right")) {
plots <- list(...)
position <- match.arg(position)
g <- ggplotGrob(plots[[1]] + theme(legend.position = position))$grobs
legend <- g[[which(sapply(g, function(x) x$name) == "guide-box")]]
lheight <- sum(legend$height)
lwidth <- sum(legend$width)
gl <- lapply(plots, function(x) x + theme(legend.position = "none"))
gl <- c(gl, nrow = nrow, ncol = ncol)
combined <- switch(position,
"bottom" = arrangeGrob(do.call(arrangeGrob, gl),
legend,
ncol = 1,
heights = unit.c(unit(1, "npc") - lheight, lheight)),
"right" = arrangeGrob(do.call(arrangeGrob, gl),
legend,
ncol = 2,
widths = unit.c(unit(1, "npc") - lwidth, lwidth)))
grid.newpage()
grid.draw(combined)
}
Дополнительные аргументы nrow а также ncol контролировать расположение упорядоченных участков:
dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
p1 <- qplot(carat, price, data = dsamp, colour = clarity)
p2 <- qplot(cut, price, data = dsamp, colour = clarity)
p3 <- qplot(color, price, data = dsamp, colour = clarity)
p4 <- qplot(depth, price, data = dsamp, colour = clarity)
grid_arrange_shared_legend(p1, p2, p3, p4, nrow = 1, ncol = 4)
grid_arrange_shared_legend(p1, p2, p3, p4, nrow = 2, ncol = 2)
Если вы рисуете одни и те же переменные на обоих графиках, самый простой способ - объединить кадры данных в один, а затем использовать facet_wrap.
Для вашего примера:
big_df <- rbind(df1,df2)
big_df <- data.frame(big_df,Df = rep(c("df1","df2"),
times=c(nrow(df1),nrow(df2))))
ggplot(big_df,aes(x=x, y=y,colour=group))
+ geom_point(position=position_jitter(w=0.04,h=0.02),size=1.8)
+ facet_wrap(~Df)
Еще один пример использования набора данных о бриллиантах. Это показывает, что вы даже можете заставить его работать, если у вас есть только одна общая переменная между вашими графиками.
diamonds_reshaped <- data.frame(price = diamonds$price,
independent.variable = c(diamonds$carat,diamonds$cut,diamonds$color,diamonds$depth),
Clarity = rep(diamonds$clarity,times=4),
Variable.name = rep(c("Carat","Cut","Color","Depth"),each=nrow(diamonds)))
ggplot(diamonds_reshaped,aes(independent.variable,price,colour=Clarity)) +
geom_point(size=2) + facet_wrap(~Variable.name,scales="free_x") +
xlab("")
Единственная сложность второго примера в том, что факторные переменные преобразуются в числовые, когда вы объединяете все в один фрейм данных. Поэтому в идеале вы будете делать это в основном тогда, когда все интересующие вас переменные имеют одинаковый тип.
Если легенда одинакова для обоих графиков, существует простое решение, использующее grid.arrange(при условии, что вы хотите, чтобы легенда выровнялась с обоими графиками либо по вертикали, либо по горизонтали). Просто сохраните легенду для самого нижнего или самого правого графика, опуская легенду для другого. Однако добавление легенды только к одному графику изменяет размер одного участка относительно другого. Чтобы избежать этого, используйтеheightsкоманда, чтобы вручную настроить и сохранить их одинаковый размер. Вы даже можете использоватьgrid.arrangeсделать общие заголовки осей. Обратите внимание, что для этого потребуетсяlibrary(grid) в добавление к library(gridExtra). Для вертикальных графиков:
y_title <- expression(paste(italic("E. coli"), " (CFU/100mL)"))
grid.arrange(arrangeGrob(p1, theme(legend.position="none"), ncol=1), arrangeGrob(p2, theme(legend.position="bottom"), ncol=1), heights=c(1,1.2), left=textGrob(y_title, rot=90, gp=gpar(fontsize=20)))
Вот результат аналогичного графика для проекта, над которым я работал:
@Guiseppe:
Я не имею ни малейшего представления о Гробсе и т. Д., Но я взломал решение для двух графиков, должно быть возможно расширить до произвольного числа, но это не в сексуальной функции:
plots <- list(p1, p2)
g <- ggplotGrob(plots[[1]] + theme(legend.position="bottom"))$grobs
legend <- g[[which(sapply(g, function(x) x$name) == "guide-box")]]
lheight <- sum(legend$height)
tmp <- arrangeGrob(p1 + theme(legend.position = "none"), p2 + theme(legend.position = "none"), layout_matrix = matrix(c(1, 2), nrow = 1))
grid.arrange(tmp, legend, ncol = 1, heights = unit.c(unit(1, "npc") - lheight, lheight))