R: передать аргумент glm внутри функции R

Question

Я пытаюсь привыкнуть к решению проблем в R. Я хотел бы вызвать функцию glm() внутри функции, но она не работает, по-видимому, из-за ограниченных масштабов мне не удалось исправить с помощью функций assign() или же eval(),

Вот упрощенная версия:

ao <- function (y, x, phi = seq (0,1,0.1), dataset, weights) {
    logLikvector <- rep(0,length(phi))  # vector of zeros to be replaced thereafter
    for (i in 1:length(phi)) {          # loop to use glm()   
        fit <- glm (y ~ x, data = dataset, family = binomial, weights = weights)         
        logLikvector[i] <- logLik(fit)      # get log likelihood
    }
    logLikvector
}

Теперь я хочу использовать функцию ao() в моем наборе данных

    ao (y = Prop, x = Age, dataset = mydata, weights = Total) 

Это не работает, но работает следующее:

ao (y = mydata$Prop, x = mydata$Age, dataset = mydata, weights = mydata$Total)

Кто-нибудь знает что делать?

Любая помощь будет принята с благодарностью!!!

Кстати, вот как повторить мою проблему с набором данных, который я использую

library("MASS")
data(menarche)
mydata <- menarche
mydata$Prop <- mydata$Menarche / mydata$Total

Answer 1

Решение с заменой (предложение @DWin).

function(y, x, dataset, weights){
  f <- substitute(glm(y~x, data=dataset, weights=weights, family=binomial))
  logLik(eval(f))
}

Answer 2

Я предлагаю создать формулу с paste и вызывая функцию с do.call,

ao <- function (y, x, phi = seq (0,1,0.1), dataset, weights) {
  logLikvector <- rep(0,length(phi))  # vector of zeros to be replaced thereafter
  for (i in 1:length(phi)) {          # loop to use glm()
    f <- as.formula(paste(y, x, sep="~"))
    fit <- do.call("glm", list(formula=f, data=as.name(dataset), 
                   family="binomial", weights=as.name(weights)))
    logLikvector[i] <- logLik(fit)      # get log likelihood
  }
  logLikvector
}

Тогда назовите это так:

ao("Prop", "Age", dataset="mydata", weights="Total")

См. /questions/8747293/ispyitanie-anova-ne-vyipolnyaetsya-na-podgonkah-sozdannyih-s-pomoschyu-vstavlennoj-formulyi/8747300#8747300 для получения дополнительной информации.

Answer 3

ao <- function (x, y, phi = seq (0,1,0.1), dataset, weights) {
    logLikvector <- rep(0,length(phi))
    x <- dataset[,substitute(x)]
    y <- dataset[,substitute(y)]
    weights <- dataset[,substitute(weights)]
        for (i in 1:length(phi)) {          # loop to use glm()
        fit <- glm (y ~ x, data = dataset, family = binomial, weights = weights)
        logLikvector[i] <- logLik(fit)      # get log likelihood
    }
    return(logLikvector)
}



library("MASS")
data(menarche)
mydata <- menarche
mydata$Prop <- mydata$Menarche / mydata$Total
ao(y = "Prop",x = "Age", dataset = mydata, weights = "Total")


[1] -55.37763 -55.37763 -55.37763 -55.37763 -55.37763 -55.37763
 [7] -55.37763 -55.37763 -55.37763 -55.37763 -55.37763