Использование pull() из dplyr после чтения данных с помощью haven::read_sas сохраняет атрибуты. Как избежать?

Я работаю с несколькими наборами данных, которые изначально .sas7bdat файл.

Первоначально я загрузил все файлы, используя sas7bdat пакет, но теперь я убежден, что haven Пакет может сделать лучше и быстрее.

Тем не менее, недавно загруженные данные с haven::read_(sas) похоже, ведет себя по-другому по сравнению с sas7bdat::read.sas7bdat() когда используешь pull() от dplyr:

library("haven")
library("dplyr")
#> 
#> Attaching package: 'dplyr'
#> The following objects are masked from 'package:stats':
#> 
#>     filter, lag
#> The following objects are masked from 'package:base':
#> 
#>     intersect, setdiff, setequal, union
library("sas7bdat")

data.sas7 <- sas7bdat::read.sas7bdat(system.file("examples", "iris.sas7bdat", package = "haven"))
data.sas7 %>% summarise(mean = mean(Petal_Length)) %>% pull
#> [1] 3.758

data.haven <- haven::read_sas(system.file("examples", "iris.sas7bdat", package = "haven"))
data.haven %>% summarise(mean = mean(Petal_Length)) %>% pull
#> [1] 3.758
#> attr(,"format.sas")
#> [1] "BEST"

Создано 2019-01-31 пакетом представлением (v0.2.1)

Как видно из приведенного выше примера attr() также печатаются при загрузке данных с использованием haven, Это непрактично, например, когда я хочу напечатать результат в rmarkdown,

Мой вопрос: как я могу избежать печати атрибута при использовании pull() форма dplyr когда данные загружены haven ?

1 ответ

Решение

Сначала давайте воспроизведем похожие данные:

iris2 <- iris
attr(iris2$Petal.Length,"format.sas") <- "BEST"
iris2 %>% 
  summarise(mean = mean(Petal.Length)) %>% 
  pull
# [1] 3.758
# attr(,"format.sas")
# [1] "BEST"

Затем посмотрите первую строчку, которую я здесь использую, она удаляет атрибут "format.sas" всех столбцов:

iris2 %>% 
  mutate_all(`attr<-`,"format.sas", NULL) %>% 
  summarise(mean = mean(Petal.Length)) %>% 
  pull
# [1] 3.758

Если вы хотите удалить все атрибуты:

iris2 %>% 
  mutate_all(`attributes<-`, NULL) %>% 
  summarise(mean = mean(Petal.Length)) %>% 
  pull

# [1] 3.758
Другие вопросы по тегам