Как сделать базовое левое внешнее соединение с data.table в R?

У меня есть data.table из a и b, который я разделил на below с б <.5 и above с б> .5:

DT = data.table(a=as.integer(c(1,1,2,2,3,3)), b=c(0,0,0,1,1,1))
above = DT[DT$b > .5]
below = DT[DT$b < .5, list(a=a)]

Я хотел бы сделать левое внешнее соединение между above а также below: для каждого a в aboveпосчитать количество строк в below, Это эквивалентно следующему в SQL:

with dt as (select 1 as a, 0 as b union select 1, 0 union select 2, 0 union select 2, 1 union select 3, 1 union select 3, 1),
  above as (select a, b from dt where b > .5),
  below as (select a, b from dt where b < .5)
select above.a, count(below.a) from above left outer join below on (above.a = below.a) group by above.a;
 a | count 
---+-------
 3 |     0
 2 |     1
(2 rows)

Как мне сделать то же самое с data.tables? Это то, что я пробовал до сих пор:

> key(below) = 'a'
> below[above, list(count=length(b))]
     a count
[1,] 2     1
[2,] 3     1
[3,] 3     1
> below[above, list(count=length(b)), by=a]
Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'b' not found
> below[, list(count=length(a)), by=a][above]
     a count b
[1,] 2     1 1
[2,] 3    NA 1
[3,] 3    NA 1

Я также должен быть более конкретным в том, что я уже пытался merge но это дует через память в моей системе (и набор данных занимает только около 20% моей памяти).

4 ответа

Решение

Посмотрите, дает ли это вам что-то полезное. Ваш пример слишком мал, чтобы дать мне знать, что вы хотите, но, похоже, это может быть таблица значений above$a которые также находятся в below$a

table(above$a[above$a %in% below$a])

Если вы также хотите обратное... значения не в belowтогда это будет сделано:

table(above$a[!above$a %in% below$a])

И вы можете объединить их:

> c(table(above$a[above$a %in% below$a]),table(above$a[!above$a %in% below$a]) )
2 3 
1 2

В общем-то table а также %in% бегать по достаточно маленьким следам и быстро.

Поскольку вы, кажется, используете пакет data.table: проверять ?merge.data.table, Я не использовал его, но, похоже, это может сделать то, что вы хотите:

merge(above, below, by="a", all.x=TRUE, all.y=FALSE)

Я думаю, что это проще:

setkey(above,a)
setkey(below,a)

Левое внешнее соединение:

above[below, .N]

регулярное соединение:

above[below, .N, nomatch=0]

полное внешнее объединение со счетами:

merge(above,below, all=T)[,.N, by=a]

В конце концов я нашел способ сделать это с data.tableчто я чувствовал, что для меня более естественно понять, чем DWin tableХотя YMMV:

result = below[, list(count=length(b)), by=a]
key(result) = 'a'
result = result[J(unique(above$a))]
result$count[is.na(result$count)] = 0

Я не знаю, может ли это быть более компактным, хотя. Я особенно хотел быть в состоянии сделать что-то вроде result = below[J(unique(above$a)), list(count=length(b))], но это не работает.

Другие вопросы по тегам