Данные формата ncol в пакете igraph
В документе http://igraph.sourceforge.net/doc/R/read.graph.html
Формат NCOL
Этот формат используется программой Large Graph Layout ( http://bioinformatics.icmb.utexas.edu/lgl), и это просто символический список взвешенных ребер. Это простой текстовый файл с одним ребром в строке. Ребро определяется двумя символическими именами вершин, разделенными пробелами. (Сами символические имена вершин не могут содержать пробелов.) За ними может следовать необязательное число, это будет вес ребра; число может быть отрицательным и может быть в научной записи. Если для ребра не указан вес, предполагается, что он равен нулю.
Результирующий граф всегда неориентирован. LGL не может работать с файлами, которые содержат несколько ребер или ребра петли, однако здесь это не проверяется, так как igraph доволен ими.
Что означает предложение (результирующий граф всегда ненаправленный.)?
Я читаю данные в формате ncol.
g<-read.graph("file.ncol",format="ncol",directed=TRUE)
is.directed(g)
TRUE
Результат ИСТИНА. Поэтому я думаю, что график направлен. Но почему в документе говорится, что результирующий график всегда ненаправленный?
1 ответ
Это, вероятно, ошибка в документации (или остаток от более ранней версии igraph, где directed
аргумент еще не существовал). Я предлагаю вам подать отчет об ошибке.