Как сохранить фрейм данных R в файл Excel с определенными ячейками, выделенными жирным шрифтом?

Question

Я часто пишу статьи с корреляционными матрицами. Я хотел бы иметь возможность экспортировать матрицу корреляции в Excel в формате xls или xlsx. Я также хотел бы отформатировать жирным шрифтом корреляции, которые соответствуют порогу (например, > .2). Я думал, может быть, XLConnect может обеспечить функциональность.

Чтобы упростить пример, предположим, что кадр данных выглядит следующим образом, и предположим, что я хочу выделить все ячейки больше 5.

x <- data.frame(matrix(1:9, nrow = 3))
# > x
#   X1 X2 X3
# 1  1  4  7
# 2  2  5  8
# 3  3  6  9

Кроме того, я отмечаю, что были предложены решения для скрепления ячеек для уценки:

• Как выделить ячейку в таблице (kable) в rmarkdown?
• Форматирование жирным шрифтом для значимых значений в таблице Rmarkdown

Я также нашел этот ответ, но это не очень общее решение в том смысле, что для его адаптации к общей задаче получения фрейма данных и правила форматирования требуется немало:

экспортировать фреймы данных в Excel через xlsx с условным форматированием

Answer 1

Я создал следующую функцию, которая была адаптирована из ответа @ Jota здесь

xlsx_boldcells <- function(x, matches, file = "test.xlsx", sheetname = "sheet1") {
    # x data.frame or matrix
    # matches: logical data.frame or matrix of the same size indicating which cells to bold
    # copy data frame to work book and load workbook
    require(xlsx)
    write.xlsx(x, file, sheetName=sheetname)
    wb <- loadWorkbook(file)              

    # specify conditional formatting
    # Note: this could be modified to apply different formatting
    # see ?CellStyle
    fo <- Font(wb, isBold = TRUE)  
    cs <- CellStyle(wb, font=fo)  

    # Get cell references
    sheets <- getSheets(wb)               # get all sheets
    sheet <- sheets[[sheetname]]          # get specific sheet
    rows <- getRows(sheet, rowIndex=2:(nrow(x)+1))  # get rows
    cells <- getCells(rows, colIndex = 2:(ncol(x)+1))  

    # Matches to indexes
    indm <- data.frame(which(matches, arr.ind = TRUE, useNames = FALSE)) 
    names(indm) <- c("row", "col")
    # +1 required because row and column names occupy first rows and columns
    indm$index <- paste(indm$row + 1, indm$col + 1, sep = ".")

    # apply cell style
    lapply(indm$index, function(ii) setCellStyle(cells[[ii]],cs))

    # save workbook
    saveWorkbook(wb, file)
}

Таким образом, это может быть применено к предложенной проблеме:

 xlsx_boldcells(x, x > 5)

получая:

Или это может быть применено к общей проблеме корреляции (то есть выделение больших корреляций, например, больше чем 0,6) следующим образом:

data(mtcars)
cors <- round(cor(mtcars), 2)
xlsx_boldcells(cors, abs(cors) > .6 & cors!=1, file = "cormatrix.xlsx")