Стандартизация размера выборки для переоценки Fst

Я новичок в R, поэтому, пожалуйста, будьте терпеливы.

У меня есть 4 популяции одного вида (поп в 1 столбце) с разными размерами выборки. Проведя анализ гаплотипов mitDNA (гап в другом столбце) для каждого индивидуума (каждой строки), теперь мне нужно стандартизировать размер выборки для всех популяций и оценить FST, Я полагаю, что это может быть просто сделано с помощью некоторого метода повторной выборки с дубликатами, чтобы получить случайную подвыборку в совокупностях, но я не уверен, каков правильный способ сделать это.

Кроме того, я никогда не оценивал Fst в R. Есть ли способ получить выходные данные в таблице, аналогичной приведенной ниже? Или же непосредственно применить результаты подвыборки в пакете в R, который может оценить Fst после этой процедуры?

df <- read.table(text="pop  hap
1   A
1   A
1   B
1   B
1   B
1   C
1   D
2   F
2   F
2   A
2   A
2   B
2   E
3   A
3   A
3   B
3   D
4   A
4   A
4   A
4   B
4   B", header=TRUE)

Надеюсь, я ясно дал понять.

Заранее большое спасибо.

0 ответов

Другие вопросы по тегам