Использование chisq.test в R (тесты хи-квадрат)

Question

Я пытаюсь прочитать файл CSV, а затем создать 3 матрицы из каждой строки из файла CSV и затем применить критерий хи-квадрат, используя метод chisq.test(матрица), но каким-то образом этот метод, кажется, не удается.

Это дает мне следующую ошибку:

Ошибка в sum(x): неверный тип (список) аргумента

С другой стороны, если я просто создаю матрицу, пропуская несколько чисел, она работает нормально. Я также попытался запустить str на двух типах матриц.

1. Это я создаю, используя строку из файла CSV. на что дает:

   List of 12
    $ : int 3
    $ : int 7
    $ : int 3
    $ : int 1
    $ : int 7
    $ : int 3
    $ : int 1
    $ : int 1
    $ : int 1
    $ : int 0
    $ : int 2
    $ : int 0
    - attr(*, "dim")= int [1:2] 4 3
   

2. Матрица создана с использованием некоторых чисел. на что дает:

   num [1:2, 1:3] 1 2 3 4 5 6
   

Может кто-нибудь, пожалуйста, скажите мне, что здесь происходит? Благодарю.

Answer 1

Проблема заключается в том, что ваша структура данных представляет собой массив списков, а для chisq.test() вам нужен массив числовых значений.

Одним из решений является приведение ваших данных в числовое значение с помощью as.numeric(). Я продемонстрирую это ниже. Другим решением было бы преобразовать результаты вашего read.csv() в числовые значения перед созданием массива.

# Recreate data
x <- structure(array(list(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12)), dim=c(3,4))
str(x)

List of 12
 $ : num 1
 $ : num 2
 $ : num 3
 $ : num 4
 $ : num 5
 $ : num 6
 $ : num 7
 $ : num 8
 $ : num 9
 $ : num 10
 $ : num 11
 $ : num 12
 - attr(*, "dim")= int [1:2] 3 4

# Convert to numeric array
x <- array(as.numeric(x), dim=dim(x))
str(x)

num [1:3, 1:4] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...

chisq.test(x)

    Pearson's Chi-squared test

data:  x 
X-squared = 0.6156, df = 6, p-value = 0.9961

Warning message:
In chisq.test(x) : Chi-squared approximation may be incorrect