Как объявить экспоненциальное распределение в gam() в mgcv в R
У меня есть небольшой набор данных, полученный в результате эксперимента, и я хочу подобрать модель, описывающую распределение Y как экспоненциальное со скоростью 0,5.
Мои данные:
x1 x2 y
-1.000000 -1.000000 40
1.000000 -1.000000 5
-1.000000 1.000000 14
1.000000 1.000000 10
-1.414214 0.000000 35
1.414214 0.000000 7
0.000000 -1.414214 18
0.000000 1.414214 9
0.000000 0.000000 7
0.000000 0.000000 4
0.000000 0.000000 0
0.000000 0.000000 2
Я пробовал другой способ передать функции gam тип распределения, но я всегда сталкиваюсь с исключением. Например,
model.gam = gam(y ~ x1 * x2, family = exponential(rate=0.5), data = df)
Error in gam(y ~ x1 * x2, family = exponential(rate = 0.5), data = df): family not recognized
model.gam = gam(y ~ x1 * x2, family = exponential(), data = df)
Error in check_dims(rate, target_dim = dim): argument "rate" is missing, with no default
model.gam = gam(y ~ x1 * x2, family = exponential(), data = df, rate = 0.5)
Error in check_dims(rate, target_dim = dim): argument "rate" is missing, with no default
Ваш совет будет оценен.
1 ответ
Я не думаю, что gam() поддерживает этот тип семьи.
Возможно, вы захотите рассмотреть gamlss() из пакета gamlss вместо этого вместе с дистрибутивом EXP из пакета gamlss.dist:
https://www.rdocumentation.org/packages/gamlss/versions/5.0-6/topics/gamlss
https://www.rdocumentation.org/packages/gamlss.dist/versions/5.0-4/topics/EXP
Обратите внимание, что распределение EXP имеет средний, а не показатель скорости.
См. http://www.gamlss.com/ для получения подробной информации о пакете gamlss.
Кроме того, для такого небольшого набора данных, я сомневаюсь, что вы можете использовать термин взаимодействия в вашей модели - даже подгонка двух основных эффектов может быть немного натянутой.