Получить вершины эллипса на эллиптическом ковариационном графике (создан `car::ellipse`)
Следуя этому посту, можно нарисовать эллипс с заданной матрицей формы (A):
library(car)
A <- matrix(c(20.43, -8.59,-8.59, 24.03), nrow = 2)
ellipse(c(-0.05, 0.09), shape=A, radius=1.44, col="red", lty=2, asp = 1)
Теперь, как получить главные / второстепенные (пара точек пересечения большой / малой оси и эллипса) вершины этого эллипса?
3 ответа
Для практических целей ответ @Tensibai, вероятно, достаточно хорош. Просто используйте достаточно большое значение для segments
аргумент, так что точки дают хорошее приближение к истинным вершинам.
Если вы хотите что-то более строгое, вы можете выбрать местоположение вдоль эллипса, которое максимизирует / минимизирует расстояние от центра, параметризованное углом. Это сложнее, чем просто angle={0, pi/2, pi, 3pi/2}
из-за наличия матрицы формы. Но это не так уж сложно
# location along the ellipse
# linear algebra lifted from the code for ellipse()
ellipse.loc <- function(theta, center, shape, radius)
{
vert <- cbind(cos(theta), sin(theta))
Q <- chol(shape, pivot=TRUE)
ord <- order(attr(Q, "pivot"))
t(center + radius*t(vert %*% Q[, ord]))
}
# distance from this location on the ellipse to the center
ellipse.rad <- function(theta, center, shape, radius)
{
loc <- ellipse.loc(theta, center, shape, radius)
(loc[,1] - center[1])^2 + (loc[,2] - center[2])^2
}
# ellipse parameters
center <- c(-0.05, 0.09)
A <- matrix(c(20.43, -8.59, -8.59, 24.03), nrow=2)
radius <- 1.44
# solve for the maximum distance in one hemisphere (hemi-ellipse?)
t1 <- optimize(ellipse.rad, c(0, pi - 1e-5), center=center, shape=A, radius=radius, maximum=TRUE)$m
l1 <- ellipse.loc(t1, center, A, radius)
# solve for the minimum distance
t2 <- optimize(ellipse.rad, c(0, pi - 1e-5), center=center, shape=A, radius=radius)$m
l2 <- ellipse.loc(t2, center, A, radius)
# other points obtained by symmetry
t3 <- pi + t1
l3 <- ellipse.loc(t3, center, A, radius)
t4 <- pi + t2
l4 <- ellipse.loc(t4, center, A, radius)
# plot everything
MASS::eqscplot(center[1], center[2], xlim=c(-7, 7), ylim=c(-7, 7), xlab="", ylab="")
ellipse(center, A, radius, col="red", lty=2)
points(rbind(l1, l2, l3, l4), cex=2, col="blue", lwd=2)
Я знаю, что этот вопрос был сочтен решенным, но на самом деле есть очень элегантное решение, всего лишь в нескольких строках. Такое вычисление является точным, без какой-либо числовой оптимизации.
## target covariance matrix
A <- matrix(c(20.43, -8.59,-8.59, 24.03), nrow = 2)
E <- eigen(A, symmetric = TRUE) ## symmetric eigen decomposition
U <- E[[2]] ## eigen vectors, i.e., rotation matrix
D <- sqrt(E[[1]]) ## root eigen values, i.e., scaling factor
r <- 1.44 ## radius of original circle
Z <- rbind(c(r, 0), c(0, r), c(-r, 0), c(0, -r)) ## original vertices on major / minor axes
Z <- tcrossprod(Z * rep(D, each = 4), U) ## transformed vertices on major / minor axes
# [,1] [,2]
#[1,] -5.055136 6.224212
#[2,] -4.099908 -3.329834
#[3,] 5.055136 -6.224212
#[4,] 4.099908 3.329834
C0 <- c(-0.05, 0.09) ## new centre
Z <- Z + rep(C0, each = 4) ## shift to new centre
# [,1] [,2]
#[1,] -5.105136 6.314212
#[2,] -4.149908 -3.239834
#[3,] 5.005136 -6.134212
#[4,] 4.049908 3.419834
Чтобы объяснить математику, я собираюсь сделать 3 шага:
- Откуда этот Эллипс?
- Метод разложения Холецкого и его недостатки.
- Метод собственных разложений и его естественная интерпретация.
Откуда этот эллипс?
На практике этот эллипс можно получить путем некоторого линейного преобразования в единичный круг x ^ 2 + y ^ 2 = 1
,
Метод разложения Холецкого и его недостатки
## initial circle
r <- 1.44
theta <- seq(0, 2 * pi, by = 0.01 * pi)
X <- r * cbind(cos(theta), sin(theta))
## target covariance matrix
A <- matrix(c(20.43, -8.59,-8.59, 24.03), nrow = 2)
R <- chol(A) ## Cholesky decomposition
X1 <- X %*% R ## linear transformation
Z <- rbind(c(r, 0), c(0, r), c(-r, 0), c(0, -r)) ## original vertices on major / minor axes
Z1 <- Z %*% R ## transformed coordinates
## different colour per quadrant
g <- floor(4 * (1:nrow(X) - 1) / nrow(X)) + 1
## draw ellipse
plot(X1, asp = 1, col = g)
points(Z1, cex = 1.5, pch = 21, bg = 5)
## draw circle
points(X, col = g, cex = 0.25)
points(Z, cex = 1.5, pch = 21, bg = 5)
## draw axes
abline(h = 0, lty = 3, col = "gray", lwd = 1.5)
abline(v = 0, lty = 3, col = "gray", lwd = 1.5)
Мы видим, что матрица линейного преобразования R
не имеет естественной интерпретации. Исходные вершины круга не отображаются на вершины эллипса.
Метод собственных разложений и его естественная интерпретация
## initial circle
r <- 1.44
theta <- seq(0, 2 * pi, by = 0.01 * pi)
X <- r * cbind(cos(theta), sin(theta))
## target covariance matrix
A <- matrix(c(20.43, -8.59,-8.59, 24.03), nrow = 2)
E <- eigen(A, symmetric = TRUE) ## symmetric eigen decomposition
U <- E[[2]] ## eigen vectors, i.e., rotation matrix
D <- sqrt(E[[1]]) ## root eigen values, i.e., scaling factor
r <- 1.44 ## radius of original circle
Z <- rbind(c(r, 0), c(0, r), c(-r, 0), c(0, -r)) ## original vertices on major / minor axes
## step 1: re-scaling
X1 <- X * rep(D, each = nrow(X)) ## anisotropic expansion to get an axes-aligned ellipse
Z1 <- Z * rep(D, each = 4L) ## vertices on axes
## step 2: rotation
Z2 <- tcrossprod(Z1, U) ## rotated vertices on major / minor axes
X2 <- tcrossprod(X1, U) ## rotated ellipse
## different colour per quadrant
g <- floor(4 * (1:nrow(X) - 1) / nrow(X)) + 1
## draw rotated ellipse and vertices
plot(X2, asp = 1, col = g)
points(Z2, cex = 1.5, pch = 21, bg = 5)
## draw axes-aligned ellipse and vertices
points(X1, col = g)
points(Z1, cex = 1.5, pch = 21, bg = 5)
## draw original circle
points(X, col = g, cex = 0.25)
points(Z, cex = 1.5, pch = 21, bg = 5)
## draw axes
abline(h = 0, lty = 3, col = "gray", lwd = 1.5)
abline(v = 0, lty = 3, col = "gray", lwd = 1.5)
## draw major / minor axes
segments(Z2[1,1], Z2[1,2], Z2[3,1], Z2[3,2], lty = 2, col = "gray", lwd = 1.5)
segments(Z2[2,1], Z2[2,2], Z2[4,1], Z2[4,2], lty = 2, col = "gray", lwd = 1.5)
Здесь мы видим, что на обоих этапах преобразования вершины по-прежнему отображаются в вершины. Именно на основе такого свойства мы имеем аккуратное решение, данное в самом начале.
Все еще крайне неуверенный, это действительно ответит на вопрос, но вот моя попытка:
Сначала определим центр эллипса как вектор для последующего использования:
center<-c(x=-0.05, y=0.09)
нарисуйте эллипс и получите матрицу "точек" с достаточными значениями, чтобы получить точку, достаточно близкую к точке реальности:
tmp<-ellipse(c(-0.05, 0.09), shape=A, radius=1.44, segments=1e3, col="red", lty=2,add=FALSE)
Создайте из него таблицу данных и вычислите расстояние каждой точки до центра (точка_x - центр_х)² + (точка_у - центр_у)²:
dt <- data.table(tmp)
dt[,dist:={dx=x-center[1];dy=y-center[2];dx*dx+dy*dy}]
Упорядочить вершины по расстоянию:
setorder(dt,dist)
Получите минимальные и максимальные баллы:
> tail(dt,2)
x y dist
1: 4.990415 -6.138039 64.29517
2: -5.110415 6.318039 64.29517
> head(dt,2)
x y dist
1: 4.045722 3.41267 27.89709
2: -4.165722 -3.23267 27.89709
Не добавляйте слишком много сегментов, иначе два первых значения будут двумя точками, расположенными очень близко друг к другу, а не напротив.
с визуальными результатами это звучит не очень точно в конце: