Соединить функцию внутри mutate dplyr r: вычислить вторую производную
Я хотел бы рассчитать следующую формулу на всех моих данных grouped_by(id)
$$\frac{y''}{((1+(y')^2)^{3/2}}$$
Я застреваю при прохождении функции через мутирование, потому что это дает мне неравные размеры столбцов.
Пример данных:
require(dplyr)
df<-data.frame(Time=seq(65),
SkinTemp=rnorm(65,37,0.5),
id=rep(1:10,c(5,4,10,6,7,8,9,8,4,4)))
Первая производная (ОК):
df <-df %>% group_by(id) %>% filter(n() > 1) %>%
mutate(first_d = SkinTemp - lag(SkinTemp))
df<-as.data.frame(df) #Back to data frame
Вторая производная (застряла):
drv <- function(x, y) diff(y) / diff(x) #Defined this to pass to mutate
middle_pts <- function(x) x[-1] - diff(x) / 2
second_d <-df %>% group_by(id) %>%
mutate(second_d = drv(middle_pts(Time), drv(Time, SkinTemp)))
1 ответ
Решение
diff
возвращает вектор длиной на единицу меньше исходного vector
, Функция mutate
требует, чтобы столбец возвращал ту же длину. Поэтому нам нужно добавить несколько NA
или ценность выбора
drv <- function(x, y) c(NA, (diff(y) /diff(x)))
middle_pts <- function(x) c(NA, (x[-1] - diff(x) /2))
Теперь код ОП должен работать
df %>%
group_by(id) %>%
mutate(second_d = drv(middle_pts(Time), drv(Time, SkinTemp)))