JRI - это интерфейс Java/R, который позволяет запускать R внутри приложений Java как один поток.

JRI поставляется в комплекте с rJava, поэтому лучше всего просто установить rJava. Он доступен в CRAN, поэтому вы можете использовать в R:

install.packages("rJava") 

JRI использует собственный код, но поддерживает все платформы, на которых доступна Java (или совместимая) от Sun, включая Windows, Mac OS X, Sun и Linux (как 32-битные, так и 64-битные).