Описание тега r-inla
R-INLA — это пакет в R, который делает приближенный байесовский вывод для скрытых гауссовых моделей. Этот сайт посвящен тому пакету и методологическим разработкам, которые сопровождают его.
1
ответ
Проблемы при установке пакета INLA
Когда я запускаю '' 'install.packages("INLA", repos=c(getOption("repos"), INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/testing"), dep= ИСТИНА) '' 'заставляет меня выдавать эту ошибку: Предупреждение в install.packages: невозможно открыть URL 'https://in…
14 мар '21 в 12:19
0
ответов
Ошибка: `dim <-. Haven_labelled()` не поддерживается
Я относительно новичок в R. Я пытаюсь подогнать модель CAR в R, используя файл dta от Stata. Я использую пакет INLA (я также пробовал с BayesX). Это мой код: model_linear <- inla(form_fit,family="gaussian",data=zim_child_model, control.compute=li…
17 янв '21 в 18:44
0
ответов
как установить репо для блестящего развертывания, не работающего
У меня проблема с развертыванием моего приложения Shiny. Я использую не-CRAN-пакет под названием R-INLA. Его можно установить отсюда: install.packages("INLA",repos=c(getOption("repos"),INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/testing"), dep=TRUE) Со…
16 янв '21 в 08:54
0
ответов
Проблема с версией R
При выполнении кода: N <- 100 # 500, 5000, 25000, 100000 x <- rnorm(N, mean = 6, sd = 2) y <- rnorm(N, mean = x, sd = 1) data <- list(x = x, y = y, N = N) inla(y ~ x, family = "gaussian", data = data, control.predictor = list(link = 1), …
28 май '21 в 16:36
1
ответ
Как я могу создать объект SpatialPolygons из объекта SpatialPolygonsDataFrame в R?
Я работаю над созданием модели распределения видов с помощью R-INLA, и я хочу использовать шейп-файл (.shp), который я создал в ArcPro, в качестве барьера в пространственной сетке. Я считаю, что для этого шейп-файл должен быть в формате SpatialPolyg…
02 июн '21 в 11:59
1
ответ
Создание объекта inla.graph с правильными индексными метками из объекта sf linestring
У меня есть шейп-файл, содержащий linestringsкоторый описывает связь между городами в Бразилии. Я хотел бы преобразовать эти соединения в объект соседства с кодом города, установленным в качестве имени строки, чтобы сделать его совместимым с моим фр…
24 авг '21 в 12:46
0
ответов
Почему я получаю ошибку «неизвестный класс картографа» в INLA?
Здесь есть несколько примеров кода для пакета R inlabru:https://drive.google.com/drive/folders/105VkxH1WCVnOiVGxq0ZRmgIpnrTOaRF4 Запуск 08_spatio_temporal.R дает мне ошибку в строке 127 - код: bru.terror = bru(cmp.terror, family = "binomial", data= …
29 авг '21 в 06:50
0
ответов
Выполняется другая функция (map.poly), чем вызывается - R
У меня возникают проблемы с вызовом неправильной функции при запуске другой функции. Я пытался разобраться с пространственным отображением в R и установил пакет карт . Теперь я изменил трек и запускаю другой фрагмент кода для вычисления дисперсии пр…
16 сен '21 в 23:55
0
ответов
Ошибка в validObject(.Object): недопустимый объект класса «dsparseModelMatrix»: суперкласс «Mnumeric»
Я использую байесовскую модель с INLA. Несколько месяцев назад все работало нормально. Сегодня я снова запускаю эту ошибку: Ошибка в validObject(.Object): недопустимый объект класса «dsparseModelMatrix»: суперкласс «Mnumeric» не определен в среде кл…
22 сен '21 в 14:36
0
ответов
Модель регрессии логистических гауссовских процессов с R-INLA
Кто-нибудь знает, можно ли подогнать «логистическую модель регрессии гауссовского процесса» к INLA? Модель можно найти по ссылке ниже: https://mc-stan.org/docs/2_19/stan-users-guide/fit-gp-section.html Он просто работает, заменяя линейный эффект пре…
20 сен '21 в 02:02
0
ответов
Модель INLA с пространственной автокорреляцией - бинарный ответ, биномиальный предсказатель
У меня есть переменная двоичного ответа (0/1) и предсказатель, распределенный непрерывно по шкале 0-1. В данных существует значительная пространственная автокорреляция, поэтому я использую модель INLA, чтобы учесть это. Я создал воспроизводимый прим…
11 ноя '21 в 16:56
0
ответов
R， Байесовское прогнозирование ， тенденция данных прогноза сильно отличается от тенденции исходных данных
Я попытался использовать негауссовскую модель в языковом пакете INLA R для прогнозирования данных временных рядов, но столкнулся со следующими проблемами: Модель может работать только в том случае, если исходные данные являются целыми числами, но не…
15 ноя '21 в 05:52
0
ответов
Проблемы с использованием функций INLA в R
У меня проблемы с запуском кода в R, который использует функции из R-INLAупаковка. Каждый раз, когда я пытаюсь запустить функцию, например inla.mesh.2d, я получаю это сообщение об ошибке: Error in inla.call.builtin() : INLA installation error; no su…
12 янв '22 в 17:34
1
ответ
Ошибка в inla.call.builtin(): ошибка установки INLA; файл не найден
Недавно я обновил INLA, используя inla.update на своем компьютере. Теперь каждый раз, когда я пытаюсь запустить функцию из пакета, такую как inla.mesh.2d, я получаю следующую ошибку:Ошибка в inla.call.builtin(): ошибка установки INLA; нет такого ф…
17 янв '22 в 18:49
1
ответ
Для установки пакета, отличного от CRAN, требуется зеркало CRAN.
Я пытаюсь установить INLAпакет проекта R-INLA на вычислительном кластере на базе Linux. Пакета нет на CRAN. Согласно их учебнику, достаточно использовать install.packages("INLA",repos=c(getOption("repos"),INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/sta…
26 сен '21 в 11:08
1
ответ
Как я могу записать подробный вывод модели INLA в R?
Надеюсь, этот пример иллюстрирует то, что я пытаюсь сделать. Я запускаю сравнение одного и того же простого примера, переключая подробный TRUEа также FALSE. library("INLA") test <- capture.output( { inla(speed ~ dist, data = datasets::cars, verbo…
18 фев '22 в 15:53
0
ответов
Ошибки при установке R-INLA
У меня проблема. Я пишу свою магистерскую диссертацию, и для моего исследовательского вопроса я должен использовать R-INLA. Я пытался установить пакет INLA несколько раз, но возникает ошибка, и он не работает. https://www.r-inla.org/download-install…
02 фев '21 в 12:47
1
ответ
Попытка переопределить узел p[1,1] при добавлении ковариат в модель бета-биномиальной смеси
Я продолжаю получать указанную выше ошибку, когда пытаюсь добавить ковариаты обнаружения в модель бета-биномиальной N-смеси в лохмотьях. Согласно Ройлу (2004). Биномиальная модель смеси азота может использоваться для моделирования данных о численнос…
02 апр '22 в 18:43
0
ответов
Как получить прогноз из модели INLA в R без ее подгонки?
Давайте представим, что я хочу подогнать модель INLA к большому набору данных и сделать прогноз, используя подобранную модель. Одно из решений состоит в том, чтобы включить в дату ковариаты, используемые для прогнозирования результата, присвоив резу…
09 сен '22 в 19:32
0
ответов
Как совместить апостериорное распределение параметров с новыми данными, чтобы получить прогнозы в R-INLA?
Я подогнал модель, используя R-INLA, со смесью линейных и нелинейных эффектов (но без пространственных), и я понимаю, что могу генерировать выборки апостериорного распределения параметров с помощью функции inla.posterior.sample(), но я не могу понят…
08 сен '22 в 15:00