Можно ли выделить определенные кластеры из данных drop-seq, объединить их и создать матрицу экспрессии GeneXcount (формат Bulk-Seq)
следовали сценарию R по ссылке ниже: https://github.com/jeremymsimon/MouseCortex/blob/master/E14_processing.R
Моя цель — изолировать только радиальные кластеры глии (которые будут кластерами 8, 10, 14 и 21), суммировать экспрессию во всех этих кластерах и создать матрицу экспрессии количества генов X. Можно ли добиться этого как расширение сценария выше после получения кластеров E14.5?
Я вижу примеры того, как сделать вышеизложенное с объектами Seurat, но я не уверен, применимо ли это к объекту класса S4 в этом сценарии.