Земснаряд на модели без опознавательных знаков (R MuMIn)
Я углубляю модель без опознавательных знаков и столкнулся с несколькими препятствиями:
1) После первого углубления в компоненте обнаружения модели, я пытаюсь выделить компонент занятости модели с фиксированным поднабором предикторов, ранее выбранных для компонента обнаружения, следующим образом:
global_occ <-occu( ~ Freq + I(Freq^2) + n +mean_tree_d9 + mean_tree_kurt ~ C1 + C2 + C3 + C4 + S1 + S2 + S3 + S4 + Hour + I(Hour^2) + Deg_class + Freq_fire + age + Freq + mean_tree_d9 + mean_tree_d4 + mean_tree_d2 + mean_shrub_stdev + mean_tree_kurt + mean_tree_mad, umf_all)
system.time(dredge_occ<-pdredge(global_occ, rank=AIC, m.max=5, cluster=clust, fixed=`p(Freq)`&`p(I(Freq^2))`&`p(n)`&`p(mean_tree_d9)`&`p(mean_tree_kurt)`))
> dredge_occ
Global model call: occu(formula = ~Freq + I(Freq^2) + n + mean_tree_d9 + mean_tree_kurt ~
C1 + C2 + C3 + C4 + S1 + S2 + S3 + S4 + Hour + I(Hour^2) +
Deg_class + Freq_fire + age + Freq + mean_tree_d9 + mean_tree_d4 +
mean_tree_d2 + mean_shrub_stdev + mean_tree_kurt + mean_tree_mad, data = umf_all)
---
Model selection table
p(Int) psi(Int) p(Frq) p(I(Frq^2)) p(men_tre_d9) p(men_tre_krt) p(n) df logLik AIC delta weight
31 -8.68 -1.93 -8.518 -2.439 -0.2369 -0.2295 0.07039 7 -9664.791 19343.6 0 1
Models ranked by AIC(x)
ОБНОВЛЕНИЕ: я попытался использовать решение Камиля ниже, но оно не работало, потому что параметр "m.max" налагает универсальное ограничение (между компонентами p и psi) на максимальное количество переменных для любой отдельной модели и поэтому не позволяет любые пси-ковариаты для установки...
1 ответ
?dredge
говорит: fixed
"либо односторонний formula
или символьный вектор, дающий имена терминов ". В вашем случае это выражение (подходит как subset
аргумент). Итак, ваш код должен читать:
pdredge(global_occ, rank=AIC, m.max=5, cluster=clust, fixed=c("p(Freq)", "p(I(Freq^2))", "p(n)", "p(mean_tree_d9)", "p(mean_tree_kurt)"))