Земснаряд на модели без опознавательных знаков (R MuMIn)

Я углубляю модель без опознавательных знаков и столкнулся с несколькими препятствиями:

1) После первого углубления в компоненте обнаружения модели, я пытаюсь выделить компонент занятости модели с фиксированным поднабором предикторов, ранее выбранных для компонента обнаружения, следующим образом:

global_occ <-occu( ~ Freq + I(Freq^2) + n  +mean_tree_d9 + mean_tree_kurt  ~ C1 + C2 + C3 + C4 + S1 + S2 + S3 + S4 + Hour + I(Hour^2) + Deg_class + Freq_fire + age + Freq + mean_tree_d9 + mean_tree_d4 + mean_tree_d2 + mean_shrub_stdev + mean_tree_kurt + mean_tree_mad, umf_all)

system.time(dredge_occ<-pdredge(global_occ, rank=AIC, m.max=5, cluster=clust, fixed=`p(Freq)`&`p(I(Freq^2))`&`p(n)`&`p(mean_tree_d9)`&`p(mean_tree_kurt)`))


> dredge_occ

Global model call: occu(formula = ~Freq + I(Freq^2) + n + mean_tree_d9 + mean_tree_kurt ~ 
    C1 + C2 + C3 + C4 + S1 + S2 + S3 + S4 + Hour + I(Hour^2) + 
        Deg_class + Freq_fire + age + Freq + mean_tree_d9 + mean_tree_d4 + 
        mean_tree_d2 + mean_shrub_stdev + mean_tree_kurt + mean_tree_mad, data = umf_all)
---
Model selection table 
   p(Int) psi(Int) p(Frq) p(I(Frq^2)) p(men_tre_d9) p(men_tre_krt)    p(n) df    logLik     AIC delta weight
31  -8.68    -1.93 -8.518      -2.439       -0.2369        -0.2295 0.07039  7 -9664.791 19343.6     0      1
Models ranked by AIC(x) 

ОБНОВЛЕНИЕ: я попытался использовать решение Камиля ниже, но оно не работало, потому что параметр "m.max" налагает универсальное ограничение (между компонентами p и psi) на максимальное количество переменных для любой отдельной модели и поэтому не позволяет любые пси-ковариаты для установки...

1 ответ

Решение

?dredge говорит: fixed "либо односторонний formula или символьный вектор, дающий имена терминов ". В вашем случае это выражение (подходит как subset аргумент). Итак, ваш код должен читать: pdredge(global_occ, rank=AIC, m.max=5, cluster=clust, fixed=c("p(Freq)", "p(I(Freq^2))", "p(n)", "p(mean_tree_d9)", "p(mean_tree_kurt)"))

Другие вопросы по тегам